پیش بینی برهمکنش بین ترکیبات موجود در بره موم زنبور عسل و بخش آنتی ژن حفاظت کننده موجود در سم سیاه زخم با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیک
نویسندگان
چکیده
زمینه و هدف: آنتی ژن حفاظت کننده از بخش های ساختاری در یکی در سم سیاه زخم می باشد و پس از تاثیر سم برگیرنده سلولی، نقش مهمی در بیماری زایی سم ایفا می کند. هدف از این مطالعه بررسی برهمکنش بیوانفورماتیکی آنتی ژن حفاظت کننده سیاه زخم و چهار ترکیب مهم موجود در بره موم زنبور عسل شامل کافئیک اسید، ﺑﻨﺰﯾﻞ کافئات، سینامیک اسید و کامپفرول با استفاده از نرم افزارها و وبگاه های بیوانفورماتیکی بود. روش بررسی: این پژوهش با استفاده از الگوریتم های مختلف موجود در پایگاه های بیوانفورماتیکی در سال 1393 در دانشگاه علوم پزشکی اصفهان و دانشگاه آزاد اسلامی واحد خوراسگان انجام گرفت. برهمکنش گیرنده با هر کدام از لیگاندها، با استفاده از وب سرورهای swissdock (http://www.swissdock.ch/) و bsp-slim (http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/bsp-slim/) به دست آمد. نتایج داکینگ (docking) به صورت عدد بر حسب کیلوکالری بر مول (kcal/mol) مشخص شد. یافته ها: بررسی برهمکنش ترکیبات موجود در بره موم و آنتی ژن خفاظت کننده با استفاده از سرور bsp-slim نشان داد که بیشترین برهمکنش به ترتیب مربوط به ترکیبات کافئیک اسید، ﺑﻨﺰﯾﻞ کافئات، سینامیک اسید و کامپفرول بود. نتایج مربوط به برهمکنش لیگاندهای مورد نظر و آنتی ژن حفاظت کننده با استفاده از سرور swissdock نشان داد که ترکیب کافئیک اسید، δg برابر با kcal/mol 10/9 و fullfitness برابر با kcal/mol 16/993 داشت. بررسی و تحلیل برهمکنش لیگاندها با آمینواسیدهای وآنتی ژن حفاظت کننده نشان داد که بیشترین برهمکنش در ترکیب کافئیک اسید مربوط به اسید آمینه گلوتامیک اسید 117 با انرژی برابر با kcal/mol 5429/15 بود. نتیجه گیری: گلوتامیک اسید 117 در اتصال آنتی ژن حفاظت کننده و گیرنده سلولی آن و در پی آن بیماری زایی سم تاثیر چشمگیری دارد.
منابع مشابه
پیش‌بینی برهمکنش بین ترکیبات موجود در برهموم زنبور عسل و بخش آنتی‌ژن حفاظت‌کننده موجود در سم سیاه زخم با استفاده از نرم‌افزارهای بیوانفورماتیک
Background: Protective antigen of anthrax toxin, after touching the cell receptors, plays an important role in the pathogenesis of toxin. The purpose of this study was to investigate the interaction of anthrax toxin protective antigen and four great combination propolis included caffeic acid, benzyl caffeate, cinnamic acid and kaempferol using the softwares and bioinformatics web servers. ...
متن کاملاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملکاربردهای دارویی و پزشکی بره موم زنبور عسل
بره موم زنبور عسل پس از محصول عسل و ژل رویال سومین فرآورده مهم زنبور عسل (Apis mellifera) میباشد. سابقهی استفاده از بره موم به 3000 سال پیش از میلاد میرسد. از بره موم به شکل کامل، عصاره آبی، الکلی، آبی-الکلی و یا عصاره دیگر حلالها استفاده میشود. برهموم خاصیت آنتی اکسیدانی قابل توجهی دارد و ترکیبات آنتی اکسیدان موجود در برهموم نقش بسزایی در خواص مختلف آن از جمله ایمنیزایی ایفا ...
متن کاملاثر ضد باکتریائی بره موم زنبور عسل روی تعدادی از باکتریهای بیماریزا
ABSTRACT Propolis or bee glue is a production of hive with resine nature which had been known from ancient times and was used in treatment of infectious disease. At present time it is still widely used in the eastern parts of Europe. The use of propolis for its antibacterial, antiviral, antifungal and certain other useful pharmacologic effects is increasing. Because of difference between the s...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
مجله دانشکده پزشکی دانشگاه علوم پزشکی تهرانجلد ۷۴، شماره ۱۰، صفحات ۷۱۵-۷۲۲
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023